José Sócrates está acusado de 31 crimes de corrupção passiva de titular de cargo político, branqueamento de capitais, falsificação de documento e fraude fiscal qualificada. Nos próximos meses, um juiz de instrução decidirá se todos os 28 arguidos seguirão para julgamento.
A investigação ao banco BES dura há vários anos e é outra das pastas quentes que Marques Vidal deixa a Lucília Gago. Conta 17 arguidos, 14 pessoas singulares e três coletivas, sendo Ricardo Salgado o mais mediático.
Foi também durante o mandato de Joana Marques Vidal que se iniciou a Operação Lex, o caso no qual o juiz Rui Rangel é acusado de vender sentenças. Segundo a investigação, o desembargador oferecia-se, também, para influenciar colegas e era ajudado pela ex-mulher, a juíza Fátima Galante, a escrever os acórdãos.